Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabra2P26048 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabra2P26048 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabra2P26048 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabra2P26048 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabra2P26048 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabra2P26048 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra2P26048 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms