Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aldh1a1P24549 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Aldh1a1P24549 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms