Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata3P23772 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata3P23772 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata3P23772 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata3P23772 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata3P23772 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gata3P23772 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata3P23772 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms