Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfyaP23708 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfyaP23708 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfyaP23708 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfyaP23708 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfyaP23708 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfyaP23708 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms