Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Eif3aP23116 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Eif3aP23116 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Eif3aP23116 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Eif3aP23116 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Eif3aP23116 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Eif3aP23116 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Eif3aP23116 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Eif3aP23116 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Eif3aP23116 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Eif3aP23116 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Eif3aP23116 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Eif3aP23116 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Eif3aP23116 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Eif3aP23116 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Eif3aP23116 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms