Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmnb2P21619 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmnb2P21619 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmnb2P21619 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms