Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Abcb1aP21447 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcb1aP21447 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Abcb1aP21447 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Abcb1aP21447 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Abcb1aP21447 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcb1aP21447 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcb1aP21447 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcb1aP21447 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcb1aP21447 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcb1aP21447 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcb1aP21447 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcb1aP21447 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcb1aP21447 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms