Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BdnfP21237 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BdnfP21237 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BdnfP21237 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BdnfP21237 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BdnfP21237 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BdnfP21237 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BdnfP21237 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BdnfP21237 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BdnfP21237 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BdnfP21237 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BdnfP21237 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BdnfP21237 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BdnfP21237 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BdnfP21237 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BdnfP21237 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BdnfP21237 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BdnfP21237 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BdnfP21237 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BdnfP21237 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BdnfP21237 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BdnfP21237 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BdnfP21237 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BdnfP21237 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BdnfP21237 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BdnfP21237 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BdnfP21237 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BdnfP21237 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BdnfP21237 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BdnfP21237 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BdnfP21237 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BdnfP21237 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BdnfP21237 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BdnfP21237 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BdnfP21237 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BdnfP21237 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BdnfP21237 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BdnfP21237 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BdnfP21237 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BdnfP21237 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BdnfP21237 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BdnfP21237 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BdnfP21237 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BdnfP21237 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BdnfP21237 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BdnfP21237 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BdnfP21237 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BdnfP21237 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BdnfP21237 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BdnfP21237 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BdnfP21237 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BdnfP21237 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BdnfP21237 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms