Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P20040 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P20040 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
P20040 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
P20040 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P20040 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
P20040 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P20040 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
P20040 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P20040 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P20040 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P20040 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
P20040 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P20040 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P20040 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P20040 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P20040 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
P20040 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
P20040 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
P20040 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P20040 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P20040 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P20040 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
P20040 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
P20040 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P20040 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
P20040 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
P20040 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P20040 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P20040 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P20040 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
P20040 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
P20040 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P20040 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
P20040 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P20040 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P20040 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
P20040 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P20040 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P20040 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P20040 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P20040 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P20040 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P20040 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P20040 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P20040 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P20040 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
P20040 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
P20040 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P20040 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P20040 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P20040 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P20040 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
P20040 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P20040 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P20040 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
P20040 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P20040 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
P20040 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
P20040 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P20040 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
P20040 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
P20040 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P20040 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P20040 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P20040 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P20040 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P20040 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P20040 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P20040 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P20040 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P20040 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P20040 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P20040 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P20040 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P20040 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P20040 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P20040 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P20040 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P20040 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P20040 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
P20040 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P20040 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P20040 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P20040 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P20040 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P20040 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
P20040 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P20040 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
P20040 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P20040 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P20040 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P20040 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P20040 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P20040 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P20040 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P20040 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P20040 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P20040 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P20040 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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