Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ms4a1P19437 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ms4a1P19437 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ms4a1P19437 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms