Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P18533 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
P18533 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P18533 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P18533 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18533 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18533 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18533 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18533 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18533 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18533 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P18533 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P18533 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P18533 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P18533 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P18533 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P18533 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P18533 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P18533 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P18533 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
P18533 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P18533 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P18533 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P18533 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P18533 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
P18533 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P18533 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P18533 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P18533 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P18533 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P18533 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P18533 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P18533 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P18533 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P18533 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P18533 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P18533 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P18533 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18533 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18533 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18533 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18533 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18533 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18533 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18533 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18533 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18533 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18533 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18533 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P18533 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
P18533 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P18533 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P18533 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P18533 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P18533 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
P18533 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P18533 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P18533 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
P18533 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P18533 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P18533 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P18533 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P18533 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P18533 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
P18533 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
P18533 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P18533 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P18533 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P18533 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
P18533 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P18533 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
P18533 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P18533 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P18533 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P18533 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P18533 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P18533 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P18533 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P18533 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P18533 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P18533 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P18533 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P18533 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P18533 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P18533 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P18533 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P18533 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P18533 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P18533 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P18533 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
P18533 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P18533 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P18533 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P18533 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P18533 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P18533 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P18533 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P18533 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P18533 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P18533 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms