Protein–RNA interactions for Protein: P18155

Mthfd2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd2P18155 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mthfd2P18155 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mthfd2P18155 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mthfd2P18155 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mthfd2P18155 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mthfd2P18155 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mthfd2P18155 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mthfd2P18155 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mthfd2P18155 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Mthfd2P18155 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mthfd2P18155 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mthfd2P18155 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mthfd2P18155 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mthfd2P18155 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mthfd2P18155 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mthfd2P18155 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mthfd2P18155 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mthfd2P18155 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mthfd2P18155 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mthfd2P18155 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mthfd2P18155 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mthfd2P18155 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mthfd2P18155 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mthfd2P18155 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mthfd2P18155 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Mthfd2P18155 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mthfd2P18155 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mthfd2P18155 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mthfd2P18155 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mthfd2P18155 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms