Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra6P16305 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabra6P16305 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra6P16305 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra6P16305 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra6P16305 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra6P16305 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra6P16305 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra6P16305 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra6P16305 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra6P16305 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra6P16305 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra6P16305 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabra6P16305 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabra6P16305 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabra6P16305 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabra6P16305 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabra6P16305 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabra6P16305 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms