Protein–RNA interactions for Protein: P12656

Tshb, Thyrotropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TshbP12656 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TshbP12656 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TshbP12656 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TshbP12656 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TshbP12656 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TshbP12656 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TshbP12656 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TshbP12656 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TshbP12656 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TshbP12656 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TshbP12656 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TshbP12656 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TshbP12656 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TshbP12656 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TshbP12656 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TshbP12656 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TshbP12656 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TshbP12656 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TshbP12656 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TshbP12656 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TshbP12656 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TshbP12656 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TshbP12656 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TshbP12656 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TshbP12656 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TshbP12656 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TshbP12656 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TshbP12656 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TshbP12656 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TshbP12656 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TshbP12656 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TshbP12656 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TshbP12656 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TshbP12656 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TshbP12656 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TshbP12656 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TshbP12656 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TshbP12656 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TshbP12656 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TshbP12656 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TshbP12656 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TshbP12656 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TshbP12656 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TshbP12656 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TshbP12656 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TshbP12656 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TshbP12656 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TshbP12656 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TshbP12656 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TshbP12656 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TshbP12656 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TshbP12656 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TshbP12656 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TshbP12656 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TshbP12656 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TshbP12656 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TshbP12656 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TshbP12656 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TshbP12656 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TshbP12656 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TshbP12656 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TshbP12656 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TshbP12656 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TshbP12656 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TshbP12656 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TshbP12656 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TshbP12656 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TshbP12656 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TshbP12656 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TshbP12656 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TshbP12656 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TshbP12656 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TshbP12656 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TshbP12656 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TshbP12656 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TshbP12656 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TshbP12656 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TshbP12656 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TshbP12656 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TshbP12656 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TshbP12656 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TshbP12656 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TshbP12656 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TshbP12656 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TshbP12656 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TshbP12656 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TshbP12656 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TshbP12656 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TshbP12656 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TshbP12656 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TshbP12656 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TshbP12656 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TshbP12656 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TshbP12656 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TshbP12656 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TshbP12656 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TshbP12656 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TshbP12656 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TshbP12656 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TshbP12656 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms