Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd1d1P11609 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd1d1P11609 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms