Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd4P10628 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms