Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P10404 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P10404 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P10404 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P10404 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P10404 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P10404 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P10404 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P10404 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P10404 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P10404 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P10404 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P10404 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P10404 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P10404 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P10404 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P10404 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P10404 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P10404 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P10404 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P10404 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P10404 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P10404 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P10404 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P10404 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P10404 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P10404 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P10404 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P10404 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P10404 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P10404 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P10404 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P10404 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P10404 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P10404 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P10404 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P10404 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P10404 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P10404 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P10404 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P10404 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P10404 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P10404 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P10404 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P10404 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P10404 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P10404 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P10404 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P10404 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P10404 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P10404 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P10404 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P10404 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P10404 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P10404 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P10404 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P10404 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P10404 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P10404 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P10404 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P10404 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P10404 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P10404 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P10404 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P10404 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P10404 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P10404 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P10404 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P10404 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P10404 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P10404 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P10404 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P10404 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P10404 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P10404 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P10404 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P10404 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P10404 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P10404 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P10404 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P10404 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P10404 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P10404 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P10404 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P10404 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P10404 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P10404 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P10404 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P10404 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P10404 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P10404 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P10404 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P10404 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P10404 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P10404 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P10404 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P10404 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P10404 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P10404 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P10404 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms