Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calm3P0DP28 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Calm3P0DP28 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Calm3P0DP28 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calm3P0DP28 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms