Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb1P09055 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb1P09055 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb1P09055 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms