Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd3P09027 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd3P09027 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd3P09027 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms