Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc8P09025 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc8P09025 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc8P09025 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms