Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa5P09021 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa5P09021 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms