Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spta1P08032 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spta1P08032 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spta1P08032 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spta1P08032 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spta1P08032 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spta1P08032 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spta1P08032 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spta1P08032 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spta1P08032 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spta1P08032 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spta1P08032 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spta1P08032 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spta1P08032 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Spta1P08032 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spta1P08032 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spta1P08032 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms