Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna4P07351 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifna4P07351 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms