Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TnfP06804 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TnfP06804 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TnfP06804 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TnfP06804 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TnfP06804 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TnfP06804 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TnfP06804 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TnfP06804 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TnfP06804 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TnfP06804 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TnfP06804 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TnfP06804 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TnfP06804 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TnfP06804 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TnfP06804 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TnfP06804 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TnfP06804 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnfP06804 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnfP06804 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnfP06804 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnfP06804 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnfP06804 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnfP06804 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TnfP06804 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TnfP06804 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TnfP06804 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TnfP06804 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TnfP06804 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TnfP06804 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TnfP06804 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnfP06804 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnfP06804 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnfP06804 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TnfP06804 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TnfP06804 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TnfP06804 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TnfP06804 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TnfP06804 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TnfP06804 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TnfP06804 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TnfP06804 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TnfP06804 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TnfP06804 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TnfP06804 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TnfP06804 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TnfP06804 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TnfP06804 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TnfP06804 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TnfP06804 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TnfP06804 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TnfP06804 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TnfP06804 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TnfP06804 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TnfP06804 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TnfP06804 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TnfP06804 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TnfP06804 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TnfP06804 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TnfP06804 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TnfP06804 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TnfP06804 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TnfP06804 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TnfP06804 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TnfP06804 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TnfP06804 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TnfP06804 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TnfP06804 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TnfP06804 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TnfP06804 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TnfP06804 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TnfP06804 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TnfP06804 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TnfP06804 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TnfP06804 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TnfP06804 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TnfP06804 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TnfP06804 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TnfP06804 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TnfP06804 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TnfP06804 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TnfP06804 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TnfP06804 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TnfP06804 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TnfP06804 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TnfP06804 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TnfP06804 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TnfP06804 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TnfP06804 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TnfP06804 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TnfP06804 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TnfP06804 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnfP06804 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnfP06804 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnfP06804 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnfP06804 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnfP06804 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnfP06804 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnfP06804 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnfP06804 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms