Protein–RNA interactions for Protein: P06795

Abcb1b, Multidrug resistance protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1bP06795 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcb1bP06795 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb1bP06795 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms