Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P06335 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P06335 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P06335 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P06335 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P06335 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
P06335 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P06335 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P06335 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P06335 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P06335 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
P06335 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P06335 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P06335 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P06335 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P06335 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P06335 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P06335 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P06335 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P06335 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P06335 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P06335 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
P06335 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
P06335 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P06335 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
P06335 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P06335 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P06335 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P06335 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P06335 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P06335 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P06335 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P06335 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P06335 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P06335 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P06335 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P06335 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P06335 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P06335 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P06335 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P06335 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P06335 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P06335 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P06335 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P06335 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P06335 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
P06335 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P06335 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P06335 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P06335 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P06335 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06335 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06335 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06335 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06335 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06335 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06335 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06335 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06335 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
P06335 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06335 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06335 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06335 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06335 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06335 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P06335 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P06335 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P06335 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P06335 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P06335 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P06335 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P06335 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P06335 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P06335 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P06335 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P06335 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
P06335 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P06335 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P06335 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P06335 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P06335 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P06335 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P06335 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P06335 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P06335 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P06335 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06335 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06335 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06335 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06335 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06335 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06335 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06335 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06335 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06335 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06335 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06335 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P06335 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P06335 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P06335 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms