Protein–RNA interactions for Protein: P06327

Gm5629, Ig heavy chain V region VH558 A1/A4, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5629P06327 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5629P06327 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5629P06327 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5629P06327 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5629P06327 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5629P06327 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms