Protein–RNA interactions for Protein: P05201

Got1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1P05201 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Got1P05201 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Got1P05201 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Got1P05201 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Got1P05201 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Got1P05201 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Got1P05201 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Got1P05201 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Got1P05201 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Got1P05201 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Got1P05201 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Got1P05201 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Got1P05201 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Got1P05201 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Got1P05201 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Got1P05201 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Got1P05201 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Got1P05201 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Got1P05201 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Got1P05201 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Got1P05201 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Got1P05201 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Got1P05201 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Got1P05201 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Got1P05201 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Got1P05201 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Got1P05201 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Got1P05201 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Got1P05201 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Got1P05201 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Got1P05201 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Got1P05201 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Got1P05201 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Got1P05201 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Got1P05201 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Got1P05201 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Got1P05201 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Got1P05201 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Got1P05201 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Got1P05201 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Got1P05201 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Got1P05201 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Got1P05201 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Got1P05201 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Got1P05201 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Got1P05201 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Got1P05201 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Got1P05201 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Got1P05201 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Got1P05201 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Got1P05201 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Got1P05201 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Got1P05201 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Got1P05201 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Got1P05201 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Got1P05201 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Got1P05201 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Got1P05201 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Got1P05201 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Got1P05201 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Got1P05201 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Got1P05201 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Got1P05201 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Got1P05201 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Got1P05201 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Got1P05201 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Got1P05201 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Got1P05201 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Got1P05201 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Got1P05201 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Got1P05201 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Got1P05201 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Got1P05201 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Got1P05201 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Got1P05201 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Got1P05201 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Got1P05201 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Got1P05201 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Got1P05201 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Got1P05201 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Got1P05201 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Got1P05201 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Got1P05201 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Got1P05201 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Got1P05201 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Got1P05201 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Got1P05201 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Got1P05201 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Got1P05201 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Got1P05201 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Got1P05201 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Got1P05201 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Got1P05201 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Got1P05201 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Got1P05201 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Got1P05201 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Got1P05201 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Got1P05201 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Got1P05201 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Got1P05201 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms