Protein–RNA interactions for Protein: P04235

Cd3d, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3dP04235 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd3dP04235 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd3dP04235 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cd3dP04235 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cd3dP04235 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.3 ms