Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
P04214 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
P04214 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P04214 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P04214 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P04214 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
P04214 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P04214 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
P04214 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P04214 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P04214 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P04214 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P04214 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P04214 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P04214 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P04214 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P04214 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P04214 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
P04214 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P04214 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P04214 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P04214 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P04214 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P04214 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P04214 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P04214 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P04214 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P04214 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P04214 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P04214 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P04214 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P04214 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P04214 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P04214 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P04214 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P04214 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P04214 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P04214 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P04214 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P04214 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P04214 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
P04214 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P04214 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P04214 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P04214 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P04214 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P04214 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P04214 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P04214 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P04214 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P04214 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P04214 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P04214 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P04214 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P04214 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P04214 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P04214 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P04214 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
P04214 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P04214 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P04214 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P04214 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P04214 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P04214 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P04214 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P04214 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P04214 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
P04214 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P04214 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P04214 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P04214 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P04214 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P04214 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P04214 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P04214 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P04214 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P04214 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P04214 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P04214 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P04214 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P04214 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
P04214 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P04214 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P04214 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P04214 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P04214 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P04214 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P04214 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P04214 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P04214 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P04214 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P04214 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
P04214 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P04214 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P04214 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P04214 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P04214 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P04214 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P04214 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P04214 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms