Protein–RNA interactions for Protein: P02463

Col4a1, Collagen alpha-1(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a1P02463 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col4a1P02463 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col4a1P02463 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col4a1P02463 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Col4a1P02463 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col4a1P02463 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col4a1P02463 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Col4a1P02463 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col4a1P02463 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col4a1P02463 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col4a1P02463 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col4a1P02463 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col4a1P02463 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col4a1P02463 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col4a1P02463 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col4a1P02463 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col4a1P02463 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col4a1P02463 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col4a1P02463 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col4a1P02463 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col4a1P02463 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col4a1P02463 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col4a1P02463 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col4a1P02463 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col4a1P02463 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms