Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-Ab1P01921 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Ab1P01921 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Ab1P01921 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms