Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01853 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01853 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01853 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01853 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01853 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01853 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01853 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01853 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01853 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01853 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01853 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01853 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01853 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01853 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01853 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01853 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01853 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01853 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01853 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01853 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01853 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01853 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01853 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01853 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01853 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01853 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01853 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01853 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01853 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01853 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01853 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01853 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01853 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01853 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01853 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01853 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01853 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01853 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01853 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01853 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01853 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01853 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01853 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01853 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01853 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01853 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01853 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01853 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01853 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01853 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01853 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01853 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01853 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01853 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01853 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01853 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01853 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01853 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01853 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01853 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01853 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01853 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01853 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01853 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01853 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01853 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01853 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01853 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01853 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01853 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01853 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01853 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01853 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01853 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01853 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01853 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01853 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01853 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01853 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01853 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01853 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01853 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01853 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01853 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01853 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01853 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01853 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01853 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01853 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01853 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01853 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01853 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01853 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01853 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01853 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01853 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01853 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01853 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01853 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms