Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01789 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01789 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01789 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01789 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01789 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01789 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01789 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01789 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01789 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01789 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01789 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01789 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01789 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01789 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01789 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01789 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01789 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01789 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01789 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01789 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01789 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01789 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01789 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01789 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01789 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01789 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01789 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01789 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01789 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01789 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01789 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01789 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01789 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01789 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01789 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01789 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01789 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01789 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01789 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01789 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01789 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01789 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01789 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01789 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01789 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01789 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01789 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01789 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01789 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01789 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01789 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01789 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01789 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01789 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01789 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01789 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01789 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01789 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01789 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01789 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01789 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01789 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01789 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01789 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01789 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01789 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01789 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01789 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01789 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01789 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01789 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01789 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01789 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01789 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01789 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01789 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01789 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01789 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01789 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01789 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01789 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01789 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01789 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01789 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01789 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01789 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01789 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01789 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01789 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01789 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01789 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01789 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01789 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01789 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01789 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01789 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01789 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01789 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01789 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms