Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01658 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01658 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01658 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01658 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01658 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01658 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01658 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01658 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01658 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01658 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01658 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P01658 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P01658 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P01658 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01658 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
P01658 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01658 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01658 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01658 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01658 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01658 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01658 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01658 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01658 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01658 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01658 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01658 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01658 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01658 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01658 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01658 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01658 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01658 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01658 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01658 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01658 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01658 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01658 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01658 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01658 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01658 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01658 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01658 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01658 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
P01658 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01658 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01658 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01658 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01658 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01658 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01658 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
P01658 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01658 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01658 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01658 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01658 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01658 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01658 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01658 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01658 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01658 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01658 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01658 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01658 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01658 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01658 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01658 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01658 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01658 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01658 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01658 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01658 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01658 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01658 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01658 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01658 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
P01658 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01658 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01658 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01658 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01658 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01658 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01658 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01658 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01658 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01658 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01658 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01658 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01658 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01658 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01658 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
P01658 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01658 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01658 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01658 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01658 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01658 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01658 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01658 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms