Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mtatp6P00848 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mtatp6P00848 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms