Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CpdO89001 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CpdO89001 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CpdO89001 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CpdO89001 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CpdO89001 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CpdO89001 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CpdO89001 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CpdO89001 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CpdO89001 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CpdO89001 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CpdO89001 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CpdO89001 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CpdO89001 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CpdO89001 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CpdO89001 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CpdO89001 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CpdO89001 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CpdO89001 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CpdO89001 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CpdO89001 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CpdO89001 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CpdO89001 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CpdO89001 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CpdO89001 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CpdO89001 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CpdO89001 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CpdO89001 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CpdO89001 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CpdO89001 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CpdO89001 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CpdO89001 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CpdO89001 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CpdO89001 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CpdO89001 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CpdO89001 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CpdO89001 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CpdO89001 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CpdO89001 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CpdO89001 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CpdO89001 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CpdO89001 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CpdO89001 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CpdO89001 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CpdO89001 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CpdO89001 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CpdO89001 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CpdO89001 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CpdO89001 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CpdO89001 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CpdO89001 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CpdO89001 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CpdO89001 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CpdO89001 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CpdO89001 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CpdO89001 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CpdO89001 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CpdO89001 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CpdO89001 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CpdO89001 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CpdO89001 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CpdO89001 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CpdO89001 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CpdO89001 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CpdO89001 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CpdO89001 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CpdO89001 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CpdO89001 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CpdO89001 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CpdO89001 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CpdO89001 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CpdO89001 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CpdO89001 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CpdO89001 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CpdO89001 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CpdO89001 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CpdO89001 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CpdO89001 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CpdO89001 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CpdO89001 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CpdO89001 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CpdO89001 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CpdO89001 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CpdO89001 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CpdO89001 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CpdO89001 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CpdO89001 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CpdO89001 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CpdO89001 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CpdO89001 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CpdO89001 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CpdO89001 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CpdO89001 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CpdO89001 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CpdO89001 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CpdO89001 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CpdO89001 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CpdO89001 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CpdO89001 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CpdO89001 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.6 ms