Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd160O88875 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd160O88875 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd160O88875 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd160O88875 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd160O88875 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd160O88875 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd160O88875 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd160O88875 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd160O88875 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd160O88875 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd160O88875 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd160O88875 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd160O88875 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd160O88875 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd160O88875 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd160O88875 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd160O88875 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd160O88875 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd160O88875 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd160O88875 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd160O88875 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd160O88875 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd160O88875 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cd160O88875 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd160O88875 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd160O88875 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd160O88875 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd160O88875 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd160O88875 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd160O88875 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd160O88875 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd160O88875 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd160O88875 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd160O88875 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd160O88875 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd160O88875 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cd160O88875 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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