Protein–RNA interactions for Protein: O88451

Rdh7, Retinol dehydrogenase 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh7O88451 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rdh7O88451 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh7O88451 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdh7O88451 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms