Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc4a4O88343 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc4a4O88343 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc4a4O88343 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc4a4O88343 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc4a4O88343 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc4a4O88343 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc4a4O88343 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc4a4O88343 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc4a4O88343 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc4a4O88343 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc4a4O88343 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc4a4O88343 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc4a4O88343 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc4a4O88343 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc4a4O88343 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc4a4O88343 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc4a4O88343 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc4a4O88343 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc4a4O88343 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc4a4O88343 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc4a4O88343 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc4a4O88343 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc4a4O88343 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc4a4O88343 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc4a4O88343 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Slc4a4O88343 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc4a4O88343 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms