Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly86O88188 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly86O88188 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly86O88188 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly86O88188 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly86O88188 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly86O88188 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly86O88188 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly86O88188 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly86O88188 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly86O88188 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly86O88188 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly86O88188 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ly86O88188 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms