Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Srpk1O70551 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srpk1O70551 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srpk1O70551 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms