Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SfnO70456 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SfnO70456 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SfnO70456 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SfnO70456 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SfnO70456 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SfnO70456 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SfnO70456 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SfnO70456 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SfnO70456 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SfnO70456 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SfnO70456 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SfnO70456 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SfnO70456 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SfnO70456 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SfnO70456 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SfnO70456 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SfnO70456 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SfnO70456 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SfnO70456 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SfnO70456 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SfnO70456 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SfnO70456 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SfnO70456 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SfnO70456 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SfnO70456 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SfnO70456 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SfnO70456 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SfnO70456 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SfnO70456 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SfnO70456 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SfnO70456 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SfnO70456 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SfnO70456 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SfnO70456 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SfnO70456 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SfnO70456 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SfnO70456 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SfnO70456 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SfnO70456 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SfnO70456 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SfnO70456 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SfnO70456 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SfnO70456 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SfnO70456 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SfnO70456 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SfnO70456 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SfnO70456 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SfnO70456 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SfnO70456 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SfnO70456 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SfnO70456 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SfnO70456 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SfnO70456 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SfnO70456 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SfnO70456 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SfnO70456 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SfnO70456 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SfnO70456 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SfnO70456 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SfnO70456 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SfnO70456 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SfnO70456 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SfnO70456 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SfnO70456 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SfnO70456 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SfnO70456 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SfnO70456 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SfnO70456 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SfnO70456 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SfnO70456 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SfnO70456 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SfnO70456 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SfnO70456 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SfnO70456 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SfnO70456 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SfnO70456 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SfnO70456 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SfnO70456 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SfnO70456 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SfnO70456 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SfnO70456 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SfnO70456 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SfnO70456 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SfnO70456 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SfnO70456 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SfnO70456 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SfnO70456 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SfnO70456 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SfnO70456 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SfnO70456 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SfnO70456 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SfnO70456 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SfnO70456 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SfnO70456 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SfnO70456 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SfnO70456 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SfnO70456 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SfnO70456 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SfnO70456 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms