Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xirp1O70373 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xirp1O70373 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms