Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lnx1O70263 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lnx1O70263 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
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