Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Foxq1O70220 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxq1O70220 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxq1O70220 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Foxq1O70220 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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