Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb5O55234 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb5O55234 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb5O55234 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms