Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ChkbO55229 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChkbO55229 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChkbO55229 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChkbO55229 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChkbO55229 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ChkbO55229 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChkbO55229 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChkbO55229 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms