Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChadO55226 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChadO55226 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ChadO55226 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChadO55226 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChadO55226 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChadO55226 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChadO55226 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChadO55226 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChadO55226 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChadO55226 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChadO55226 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChadO55226 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChadO55226 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChadO55226 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChadO55226 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChadO55226 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChadO55226 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChadO55226 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChadO55226 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChadO55226 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChadO55226 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChadO55226 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChadO55226 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChadO55226 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ChadO55226 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChadO55226 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChadO55226 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChadO55226 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChadO55226 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChadO55226 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ChadO55226 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChadO55226 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChadO55226 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChadO55226 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChadO55226 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChadO55226 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ChadO55226 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ChadO55226 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ChadO55226 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChadO55226 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChadO55226 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChadO55226 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChadO55226 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChadO55226 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChadO55226 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChadO55226 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ChadO55226 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChadO55226 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChadO55226 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChadO55226 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChadO55226 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChadO55226 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChadO55226 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChadO55226 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChadO55226 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChadO55226 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChadO55226 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChadO55226 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChadO55226 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChadO55226 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChadO55226 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChadO55226 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ChadO55226 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChadO55226 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ChadO55226 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChadO55226 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChadO55226 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChadO55226 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChadO55226 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChadO55226 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChadO55226 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChadO55226 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChadO55226 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChadO55226 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChadO55226 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ChadO55226 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ChadO55226 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChadO55226 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChadO55226 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChadO55226 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ChadO55226 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ChadO55226 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ChadO55226 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChadO55226 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ChadO55226 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ChadO55226 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ChadO55226 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChadO55226 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChadO55226 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChadO55226 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChadO55226 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChadO55226 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChadO55226 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChadO55226 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ChadO55226 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChadO55226 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChadO55226 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ChadO55226 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChadO55226 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms